對于ISO三體系認證的付款方式，一般而言，認證機構會在認證前要求企業(yè)支付費用，并在證書發(fā)布后進行查詢。

在具體的認證過程中，不同的認證機構和地區(qū)可能會有不同的操作方式，所以企業(yè)在選擇認證機構和實施認證前應該詳細了解認證流程和相關規(guī)定，以免出現(xiàn)誤解或不必要的麻煩。

同時，企業(yè)也應該根據(jù)自身情況和預算合理選擇認證機構，確保認證的準確性和合法性。